Okulumuz 01.10.1969 tarihinde Niğde-Aksaray Helvadere Ortaokulu adı ile öğretime açılmıştır. Halka ait kiralık binalarda eğitim- öğretime devam ederken 1980-1981 Eğitim-Öğretim yılında 2. kanaat dönemi başında Milli Eğitim Bakanlığı tarafından yaptırılan yeni binasına taşınmıştır. 1984-1985 Eğitim-Öğretim Yılı başında Aksaray-Helvadere İlköğretim ismini alarak eğitim ve öğretime başlamıştır.

            1987-1988 Eğitim-Öğretim Yılı başından itibaren Helvadere Lisesi de okulumuz bünyesinde aynı binada 27.09.1999 tarih ve 715/3098 sayılı valilik oluru ile ayrılana kadar eğitim-öğretime devam etmiştir.

            Yukarıda belirtilen aynı onay ile Helvadere Atatürk İlköğretim Okulu, Helvadere İlköğretim Okulu binasına taşınmıştır. Böylece iki okul birleştirilmiştir. 25.10.1999 tarih ve 715/3372 sayı ile adı Helvadere Atatürk İlköğretim Okulu olarak değiştirilmiştir.

            Kasım 2000 tarihinde okulumuzun yanına Milli Eğitim Bakanlığı´mız tarafından Ek Bina yapımına başlanmıştır. 28.05.2001 tarih ve 715/1390 sayılı onay ile okulumuz ek binası da eğitim-öğretime açılmıştır.

            Helvadere Atatürk İlköğretim Okulu, 6750 m² arazisi üzerinde, 332 m²lik  İki binası (Ana ve Ek Bina olmak üzere iki ayrı binadan) eğitim ve öğretim faaliyetlerine devam etmekteyken İlkokul ve Ortaokul iki bina da ayrı ayrı iki kurum olmuştur.

            Okulumuz adını Ulu Önder Atatürk ve bulunduğu Helvadere Kasabası´ndan almaktadır.